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除了超臨界二氧化碳以外，水也可以作為有毒有機溶劑的替代品，因為水的溶解能力可以通過改變溫度來改變。通過增加壓力，水可以在高于其正常沸騰溫度（100℃）時保持液態(tài)。高于正常沸點但低于超臨界溫度（374℃）的水就是“亞臨界”水。
Helix型號的超臨界萃取系統(tǒng)可通過增加以下模塊用于亞臨界水萃取：
- 一個單獨的液體泵，將水泵入萃取釜
- 一個單獨的收集/冷凝系統(tǒng)，用于安全冷凝“過熱蒸汽”，并收集所需的萃取物
- ASI公司的標準萃取釜用于亞臨界水萃取可以達到240℃ ，可以選配最高溫度為300℃的萃取釜
